多肽合成研究已經走過了一百多年的光輝歷程，1902年，Emil Fischer首先開始關注多肽合成，由于當時在多肽合成方面的知識太少，進展也相當緩慢，直到1932年，Max Bergmann等人開始使用芐氧羰基（Z）來保護α-氨基，多肽合成才開始有了一定的發展。到了20世紀50年代，有機化學家們合成了大量的生物活性多肽，包括催產素，胰島素等，同時在多肽合成方法以及氨基酸保護基上面也取得了不少成績，這為后來的固相合成方法的出現提供了實驗和理論基礎。1963年，Merrifield提出了固相多肽合成方法（SPPS），這個在多肽化學上具有里程碑意義的合成方法，一出現就由于其合成方便，迅速，成為多肽合成的方法，而且帶來了多肽有機合成上的一次革命，并成為了一支獨立的學科——固相有機合成（SPOS），為此，Merrifield榮獲了1984年的諾貝爾化學獎。Merrifield經過了反復的篩選，zui終屏棄了芐氧羰基（Z）在固相上的使用，首先將叔丁氧羰基（BOC）用于保護α-氨基并在固相多肽合成上使用，同時，Merrifield在60年代末發明了*臺全自動多肽合成儀，并合成生物蛋白酶，核糖核酸酶（124個氨基酸）。1972，Lou Carpino首先將9-芴甲氧羰基（FMOC）用于保護α-氨基，其在堿性條件下可以迅速脫除，10min就可以反應*，而且由于其反應條件溫和，迅速得到廣泛使用，以BOC和FMOC這兩種方法為基礎的各種肽自動合成儀也相繼出現和發展，并仍在不斷得到改造和*。同時，固相合成樹脂，多肽縮合試劑以及氨基酸保護基，包括合成環肽的氨基酸正交保護上也取得了豐碩的成果。